Vybavení pro 1D a 2D agarové a PAGE elektroforézy a elektroblotting

Místo

Univerzita: Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích
Fakulta: Přírodovědecká fakulta
Fakulta: Katedra parazitologie
Ulice: Branišovská 31
Město: České Budějovice

Garant

Jméno a příjmení: František Adamec, technologický skaut

Tel.: +420 38777 6262
E-mail: Tato e-mailová adresa je chráněna před spamboty. Pro její zobrazení musíte mít povolen Javascript.

Přístroj

Výrobce: Bio-Rad, Biometra, VWR
Počet kusů:
Rok výroby: 2005 - 2009
Použití:

Agarózová elektroforéza – 1D elektroforéza (RNA, DNA) s možností analýzy velkého počtu vzorků, 2D elektroforéza (s využitím interkalačních činidel), teplotně (TGGE) a denaturačně gradientová elektroforéza (DGGE).

Polyakrylamidová elektroforéza – 1D separace nukleových kyselin a proteinů, možnost přípravy gradientových gelů, nativních elektroféz, 2D elektroforézy (nativní/SDS-PAGE, IEF/SDS-PAGE, denaturační/SDS-PAGE), isoelektrofokusace.

Elektroblotting – tankový a polosuchý blotting.

Specifikace

Labortatoř disponuje velkým množstvým elektrofretických zdrojů odpovídajících potřebám jednotlivých aplikací. Pro elektroforetickou separaci je možné využít kupovaných (tzv. Precast) gelů i gelů připravených v laboratoři včetně gelů s gradientem akrylamidu pro SDS-PAGE a nativní (BN-PAGE). Agarózové elektrofrézy umožňují součsnou analýzu více než 150 vzorků (v případě potřeby jedna analýza cca půl hodiny), pro detekci nukleových kyselin používáme predevším SYBR Green (nižší toxikologické riziko), je možné ale uplatnit i jiné detekční postupy. Nukleové kyseliny lze dále analyzovat pomocí denaturačně a teplotně gradientových metod (přesnější analýza mutací a superzvinutí u cirkulárních molekul) a také metodou RLB (reverse-line blotting). Laboratoř je vybavena též pro blotovaní nukleových kyselin a jejich další analýzu na membránách. U polyakrylamidových elektroforéz (PAGE) lze využít jednokoncentrační a gradientové gely; všechny typy gelů jsme díky doplňkovému vybavení schopni připravit. Dále lze využít isoelektrofokusaci, denaturační popřípadě nativní elektroforézu v kombinaci s SDS-PAGE jako 2D proteinovou elektroforézu.

Manuál:

http://www.bio-rad.com/webroot/web/pdf/lsr/literature/10007296.PDF

http://www.bio-rad.com/webroot/web/pdf/lsr/literature/Bulletin_9002.pdf

http://www.biometra.de/fileadmin/biometra/_products/Electrophoresis/tgge/docs/Manual_TGGE_MAXI_Oct_2009.pdf