Analysis of proteins and peptides using mass spectrometry

Identifikace izolovaných proteinů, proteinových směsí, proužků z PAGE gelů/2D elektroforézy. Analýza peptidů, posttranslačních modifikací, DeNovo sekvencace. Label Free a iTRAQ kvantifikace

Jaké je využití?
Hmotnostní spektrometrie se využívá především pro identifikaci proteinů a peptidů a stanovování proteinových profilů jak v biologii, tak i v medicíně.

V lékařských oborech je diagnostický proteomický přístup krokem pro časnou detekci nádorových onemocnění a v nalezení nových prognostických a prediktivních markerů, ale své uplatnění má i při studiu genetických onemocnění, v screeningu vrozených metabolických poruch a k detekci metabolitů, které mohou sloužit jako markery pro diferenciální diagnostiku metabolických onemocnění.
Hmotnostní spektrometrie má však své využití i v oblasti přírodních věd, kde má své uplatnění při studiu rostlinných a živočišných genomů.

Co Vám nabízíme?
Jsme otevřeni jakékoliv spolupráci, ve které mohou být využity naše znalosti.
Naše laboratoř nabízí především:
Analýza proteinů
Analýza proteinových směsí včetně kvantitativní analýzy
Proteomická analýza PAGE bandů/2D spotů
Indentifikace posttranslačních modifikací

Poskytujeme také konzultace a poradenství týkající se tématu proteonomických analýz.

Instrumentace: Hmotnostní spektrometr Q-Tof Premier (Waters); Kapalinová chromatografie NanoAcquity UPLC (Waters)

 

Completed projects

The project supported from the Operational programme Research and Development for Innovations whose aim is the setting and opening the Centre of Transfer of Technologies with two mutually co-operating departments on the side of the University of South Bohemia in České Budějovice and on the side of the Biological Centre of The Czech Academy of Sciences.

Bridge4Innovation is a project of The University of South Bohemia in České Budějovice, the South Bohemian Agency for Support of the Innovative Business and the Biological Centre of The Czech Academy of Sciences financed from the European Social Fund of the European Union.