Určení kmenů B. burgdorferi ve vzorku

Místo

Univerzita: Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích
Fakulta: Přírodovědecká fakulta
Fakulta: Katedra parazitologie
Ulice: Branišovská 31
Město: České Budějovice

Garant

Jméno a příjmení: František Adamec, technologický skaut
Tel.: +420 38777 6262
E-mail: Tato e-mailová adresa je chráněna před spamboty. Pro její zobrazení musíte mít povolen Javascript.

Specifikace

Určení kmenů Borrelia burgdorferi, které jsou přítomny ve vzorku molekulárně biologickými metodami s přesností větší v porovnání s jednoduchou PCR a realt-time PCR identifikací.

Ukázka:

Podmínky

Dle počtu vzorků

Identifikace patogenů v klíšťatech

Místo

Univerzita: Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích
Fakulta: Přírodovědecká fakulta
Fakulta: Katedra parazitologie
Ulice: Branišovská 31
Město: České Budějovice

Garant

Jméno a příjmení: František Adamec, technologický skaut
Tel.: +420 38777 6262
E-mail: Tato e-mailová adresa je chráněna před spamboty. Pro její zobrazení musíte mít povolen Javascript.

Specifikace

Identifikace různých patogenů v klíšťatech (poř. v jiných vzorcích) molekulárně biologickými metodami.

Ukázka:

Podmínky

Dle počtu vzorků, druhu a počtu identifikovaných patogenů.

Základní laboratorní vybavení

Místo

Univerzita: Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích
Fakulta: Přírodovědecká fakulta
Fakulta: Katedra parazitologie
Ulice: Branišovská 31
Město: České Budějovice

Garant

Jméno a příjmení: František Adamec, technologický skaut

Tel.: +420 38777 6262
E-mail: Tato e-mailová adresa je chráněna před spamboty. Pro její zobrazení musíte mít povolen Javascript.

Přístroj

Výrobce: Labnet, Bioer, Eppendorf, Gilson, Orange Scientific, Hettich, VWR
Počet kusů:
Rok výroby: 2000-2010
Použití:

Základní vybavení pro přípravu a zpracování vzorků.

Specifikace

Základní vybavení představujou malé přístroje a další vybavení nezbytné pro práci vlaboratoři jako jsou například automatické pipety, pipetory, centrifugy, vortexy (včetně nástavců), třepačky, pH metry, váhy a analytické váhy, sonikátory, sonikační lázně, dry bloky, třepací dry bloky, hybridizační pece a další.

Manuál:

Různé

Externista: Ne

Přesun: Ne

Podmínky zapůjčení:

PCR boxy

Místo

Univerzita: Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích
Fakulta: Přírodovědecká fakulta
Fakulta: Katedra parazitologie
Ulice: Branišovská 31
Město: České Budějovice

Garant

Jméno a příjmení: František Adamec, technologický skaut

Tel.: +420 38777 6262
E-mail: Tato e-mailová adresa je chráněna před spamboty. Pro její zobrazení musíte mít povolen Javascript.

Přístroj

Výrobce:
Počet kusů: 2
Rok výroby: 2008, 2009
Použití:

Příprava PCR reakcí v čistch podmínek, zamezení kontaminací a tím falešně pozitivních výsledků.

Specifikace

Vybaveny UV sterilizací, HEPA filtrací nasávaného vzduchu.

Manuál:

Různé

Externista: Ne

Přesun: Ne

Podmínky zapůjčení:

Inkubátory

Místo

Univerzita: Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích
Fakulta: Přírodovědecká fakulta
Fakulta: Katedra parazitologie
Ulice: Branišovská 31
Město: České Budějovice

Garant

Jméno a příjmení: František Adamec, technologický skaut

Tel.: +420 38777 6262
E-mail: Tato e-mailová adresa je chráněna před spamboty. Pro její zobrazení musíte mít povolen Javascript.

Přístroj

Výrobce: Nüve
Počet kusů: 4
Rok výroby: 1980-2010
Použití:

Kultivace buněčných kultur/tkání a provádění reakcí za stabilních teplot. Možnost využití CO2 uzavřených plastových boxů pro kultivace buněčných kultur vyžadujících náročnější podmínky.

Specifikace

Laboratoř disponuje 3 inkubátory bez možnosti chlazení (manuální a elektronické ovládání) a 1 chlazeným inkubátorem (elektronické ovládání).

Manuál:

http://www.nuve.com.tr/images/urun/pdf/es_120_-_new.pdf

Různé

Externista: Ne

Přesun: Ne

Podmínky zapůjčení:

Homogenizátor

Místo

Univerzita: Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích
Fakulta: Přírodovědecká fakulta
Fakulta: Katedra parazitologie
Ulice: Branišovská 31
Město: České Budějovice

Garant

Jméno a příjmení: František Adamec, technologický skaut

Tel.: +420 38777 6262
E-mail: Tato e-mailová adresa je chráněna před spamboty. Pro její zobrazení musíte mít povolen Javascript.

Přístroj

Výrobce: Qiagen
Počet kusů: 1
Rok výroby: 2009
Použití:

Umožňuje standardizovanou homogenizaci biologických vzorků.

Specifikace

Homogenizátor pracuje s frekvencí do 30 třepů za sekundu, homogenizace probíhá s využitím autoklávovatelných kovových kuliček, s možností současné homogenizace 48 vzorků. V případě potřeby je možné homogenizovat i za snížených teplot. Doba homogenizace do 5 minut.

Manuál:

http://www.qiagen.com/literature/render.aspx?id=200069

Různé

Externista: Ne

Přesun: Ne

Podmínky zapůjčení:

Biohazard flow-box

Místo

Univerzita: Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích
Fakulta: Přírodovědecká fakulta
Fakulta: Katedra parazitologie
Ulice: Branišovská 31
Město: České Budějovice

Garant

Jméno a příjmení: František Adamec, technologický skaut

Tel.: +420 38777 6262
E-mail: Tato e-mailová adresa je chráněna před spamboty. Pro její zobrazení musíte mít povolen Javascript.

Přístroj

Výrobce: Telstar
Počet kusů: 2
Rok výroby: 2007, 2010
Použití:

Umožňují práci v čistém prostředí, zamezují kontaminací vzorků a současně ochranu pracovníka. Vhodné pro práci s infekčním a vysoce infekčním materiálem, rovněž pro zpracování vzorků citlivých na jakékoliv kontaminace.

Specifikace

Flow-box je vybaven HEPA filtrací nasávaného i vypouštěného vzduchu HEPA (99,999% účinnost), motorizované okno s těsněním, UV sterilizace, plynový kahan, zálohovací baterie pro zavíraní okna v případě výpadku proudu, elektronické ovládání a on=line sledování funkčnosti HEPA filtrů a ostatních součástí boxu.

Manuál:

http://www.telstar-lifesciences.com/en/technologies/laminar+air+flow+systems/biosafety+cabinets/bioultra.htm

Různé

Externista: Ne

Přesun: Ne

Podmínky zapůjčení:

Termocykléry a gradientové termocykléry

Místo

Univerzita: Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích
Fakulta: Přírodovědecká fakulta
Fakulta: Katedra parazitologie
Ulice: Branišovská 31
Město: České Budějovice

Garant

Jméno a příjmení: František Adamec, technologický skaut

Tel.: +420 38777 6262
E-mail: Tato e-mailová adresa je chráněna před spamboty. Pro její zobrazení musíte mít povolen Javascript.

Přístroj

Výrobce: Bio-Rad, Eppendorf, Bioer
Počet kusů: 5 termocyklérů, 1 gradientový termocyklér, 2 termocykléry s vyměnitelnými bloky (gradientové a dvoubloky)
Rok výroby: 2004-2009
Použití:

Termocykléry se využívají při různých typech polymerázové řetězové reakce (PCR) pro amplifikaci specifických úseků DNA za účelem diagnostiky, množení DNA pro klonování, ověření přítomnosti genů/organismů apod.

Specifikace

Laboratoř je vybavena termocykléry, které umožňují široké spektrum aplikací. Díky gradientovým blokům a termocyklérům je možné provádět PCR v široké škále teplot, což umožňuje optimalizaci reakcí, popř. provádět různé reakce současně.

Manuál:

http://www.bioer.com.cn/productcentere/productcentere?id=001002

http://de.sitestat.com/eppendorf/com/s?en.download.manual.mastercycler_gradient&ns_type=pdf&ns_url=http://www.eppendorf.com/script/binres.php?RID=36322&DOW=1&pb=ea05813f16b0ff2f

http://www.bio-rad.com/webroot/web/pdf/lsr/literature/Bulletin_10968.pdf

Různé

Externista: Ne

Přesun: Ne

Podmínky zapůjčení:

Vybavení pro 1D a 2D agarové a PAGE elektroforézy a elektroblotting

Místo

Univerzita: Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích
Fakulta: Přírodovědecká fakulta
Fakulta: Katedra parazitologie
Ulice: Branišovská 31
Město: České Budějovice

Garant

Jméno a příjmení: František Adamec, technologický skaut

Tel.: +420 38777 6262
E-mail: Tato e-mailová adresa je chráněna před spamboty. Pro její zobrazení musíte mít povolen Javascript.

Přístroj

Výrobce: Bio-Rad, Biometra, VWR
Počet kusů:
Rok výroby: 2005 - 2009
Použití:

Agarózová elektroforéza – 1D elektroforéza (RNA, DNA) s možností analýzy velkého počtu vzorků, 2D elektroforéza (s využitím interkalačních činidel), teplotně (TGGE) a denaturačně gradientová elektroforéza (DGGE).

Polyakrylamidová elektroforéza – 1D separace nukleových kyselin a proteinů, možnost přípravy gradientových gelů, nativních elektroféz, 2D elektroforézy (nativní/SDS-PAGE, IEF/SDS-PAGE, denaturační/SDS-PAGE), isoelektrofokusace.

Elektroblotting – tankový a polosuchý blotting.

Specifikace

Labortatoř disponuje velkým množstvým elektrofretických zdrojů odpovídajících potřebám jednotlivých aplikací. Pro elektroforetickou separaci je možné využít kupovaných (tzv. Precast) gelů i gelů připravených v laboratoři včetně gelů s gradientem akrylamidu pro SDS-PAGE a nativní (BN-PAGE). Agarózové elektrofrézy umožňují součsnou analýzu více než 150 vzorků (v případě potřeby jedna analýza cca půl hodiny), pro detekci nukleových kyselin používáme predevším SYBR Green (nižší toxikologické riziko), je možné ale uplatnit i jiné detekční postupy. Nukleové kyseliny lze dále analyzovat pomocí denaturačně a teplotně gradientových metod (přesnější analýza mutací a superzvinutí u cirkulárních molekul) a také metodou RLB (reverse-line blotting). Laboratoř je vybavena též pro blotovaní nukleových kyselin a jejich další analýzu na membránách. U polyakrylamidových elektroforéz (PAGE) lze využít jednokoncentrační a gradientové gely; všechny typy gelů jsme díky doplňkovému vybavení schopni připravit. Dále lze využít isoelektrofokusaci, denaturační popřípadě nativní elektroforézu v kombinaci s SDS-PAGE jako 2D proteinovou elektroforézu.

Manuál:

http://www.bio-rad.com/webroot/web/pdf/lsr/literature/10007296.PDF

http://www.bio-rad.com/webroot/web/pdf/lsr/literature/Bulletin_9002.pdf

http://www.biometra.de/fileadmin/biometra/_products/Electrophoresis/tgge/docs/Manual_TGGE_MAXI_Oct_2009.pdf

Různé

Externista: Ne

Přesun: Ne

Podmínky zapůjčení:

Kapalinová chromatografie

Místo

Univerzita: Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích
Fakulta: Přírodovědecká fakulta
Fakulta: Katedra parazitologie
Ulice: Branišovská 31
Město: České Budějovice

Garant

Jméno a příjmení: František Adamec, technologický skaut

Tel.: +420 38777 6262
E-mail: Tato e-mailová adresa je chráněna před spamboty. Pro její zobrazení musíte mít povolen Javascript.

Přístroj

Výrobce: Bio-Rad
Počet kusů: 1
Rok výroby: 2005
Použití:

Přístroj slouží k separaci molekul (proteinů, nukleových kyselin, sacharidů) podle velikosti popr. na zákadě afinity s využitím různých kolon. Lze využít kolony  pro gelovou filtraci, iontověvýměnné kolony a afinitní kolony pro purifikaci protilátek, sérových proteinů, rekombinatních proteinů s tagem (His, STREP, ...). Lze použít pro analytické i preparační účely.

Specifikace

Možnost volby a kombinace dvou různých pufrů, programovatelný, isokratický tok i gradient. Sběrač frakcí 10 ml zkumavky. UV spektrometr a konduktometr pro sledování průběhu chromatografie.

Manuál:

http://www.bio-rad.com/webroot/web/pdf/WWMSDS/LSGC/USA/USA_USA_7318350.pdf

Různé

Externista: Ne

Přesun: Ne

Podmínky zapůjčení: